Le but du Backcross est de transférer une mutation d’un fond génétique à un autre.
La transmission de la mutation est testée à chaque génération en mesurant le % de marqueurs génétiques de la lignée receveuse (un panel de 2050 SNPs (souris) ou 740 SNPs (rat) est analysé et couvre l’ensemble des autosomes avec un intervalle moyen de 5 Mb). Les 2 plus hauts scores sont utilisés pour la génération suivante.
En utilisant cette technique, en maximum 5 générations les animaux sont composés à plus de 99,9% du génome receveur.
Le but du « speed congenics » ou Backcross accéléré est de diminuer de manière significative le temps requis pour transférer une mutation d’intérêt d’un fond génétique (génome donneur) vers un autre fond génétique (génome receveur).
Le temps est en général réduit de 50% comparativement au Backcross classique réalisé sur 10 générations.
- Gain de temps : réduction de 50% du temps par rapport au backcross classique. En 5 générations, animaux composés à plus de 99,9% du génome receveur
- Analyse de SNPs : à chaque génération analyse d’un panel de 2050 SNPs (souris) ou 740 SNPs (rat) sur une vingtaine d’échantillons
- Obtention d’une lignée congénique : réduction de la variabilité du phénotype du au fond génétique
Les valeurs ajoutées de JANVIER LABS :
Analyse d’un panel de 2050 SNPs (souris) ou 740 SNPs (rat). Afin d’avoir des résultats les plus représentatifs, il est conseiller d’analyser 15-20 animaux à chaque génération.
